MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017815	ATT	2	6	6	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017815	TA	3	6	58	63	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017815	AAAT	2	8	68	75	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017815	A	7	7	83	89	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017815	A	7	7	106	112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017815	ATT	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017815	ATA	2	6	133	138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017815	ATA	2	6	161	166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017815	ATA	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017815	TAA	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017815	TAAA	2	8	302	309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017815	ATT	2	6	335	340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017815	T	6	6	339	344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017815	AAT	2	6	345	350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017815	CAA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017815	ATT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017815	A	6	6	374	379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017815	CAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017815	CTT	2	6	456	461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017815	A	7	7	2230	2236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017815	N	947	947	2278	3224	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017815	CAA	2	6	3228	3233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017815	CTT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017815	AAG	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017815	AGA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017815	TTTG	2	8	3303	3310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017815	GATTT	2	10	3336	3345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017815	TCT	2	6	3355	3360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017815	TTTTTA	2	12	3361	3372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017815	TATT	2	8	3376	3383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017815	TTA	2	6	3418	3423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017815	T	6	6	3464	3469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017815	T	7	7	3471	3477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017815	TATT	2	8	3491	3498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017815	T	6	6	3513	3518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017815	ATA	2	6	3534	3539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017815	ATA	2	6	3573	3578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017815	TAG	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017815	TTTC	2	8	3644	3651	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017815	TAA	2	6	3682	3687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017815	TTG	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017815	TATT	2	8	3769	3776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017815	TTA	2	6	3796	3801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017815	TTA	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017815	TAA	3	9	3850	3858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017815	ATT	2	6	3863	3868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017815	TAA	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017815	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017815	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017815	TA	4	8	3913	3920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017815	ATA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017815	ATT	3	9	3960	3968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017815	ATT	2	6	3977	3982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017815	TA	3	6	3986	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017815	A	6	6	4018	4023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.